O Departamento de Ensino do Campus Rondonópolis é um segmento do organograma ligado diretamente à Direção Geral do Campus. Suas principais funções são planejar, coordenar, supervisionar, avaliar e desenvolver atividades relacionadas aos níveis e modalidades de ensino ofertados à sociedade.

A chefia do departamento de ensino coordena uma equipe de profissionais, entre técnicos, docentes e discentes mediante a um trabalho colaborativo com objetivo de proporcionar uma “educação para a vida e para o trabalho” a todos que buscam ingressar na instituição nos cursos Superiores e profissionalizantes de Ensino Médio Integrado ao Técnico, Ensino Médio Integrado ao Técnico – PROEJA e Ensino Médio – Subsequente.

Toda a equipe do Departamento de Ensino do IFMT Campus Rondonópolis é subdividida em coordenações e setores, que possuem pelo menos um servidor (a) responsável para que todas as demandas internas e externas possam ser atendidas em tempo hábil. As principais atribuições dos setores e/ou coordenações ligados ao Departamento de ensino são:  analisar, controlar, emitir e armazenar todos os documentos referentes à vida escolar e acadêmica dos discentes e demais documentações relativas ao Ensino.